胰蛋白酶和苯酰氨类抑制剂结合自由能的预测

胰蛋白酶和苯酰氨类抑制剂结合自由能的预测

用基于线性响应近似的自由能预测方法计算胰蛋白酶和苯酰氨类抑制剂的结合自由能.计算结果表明,单参数,双参数和三参数模型具有相似的线性回归系数,但三参数和双参数模型的交互验证回归系数要明显优于单参数模型.从预测能力来看,双参数模型和三参数模型都能够很好地预测测试集中抑制剂的结合自由能,其中双参数模型预测的结果要略优于三参数模型的预测结果.对测试集中的抑制剂,双参数模型预测得到的预测自由能和实际自由能之间平均绝对误差仅为1.15 kJ/mol.自由能计算模型以及分子动力学轨迹能很好地解释抑制剂结构和活性的关系,为药物设计提供了重要的结构信息.

作 者： 侯廷军 朱丽荔 章威 乔学斌 徐筱杰   作者单位： 北京大学化学与分子工程学院,北京大学养生堂天然药物研究室,北京,100871  刊 名： 化学学报  ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA CHIMICA SINICA  年，卷(期)： 2002 60(6)  分类号： O6  关键词： 线性响应近似   胰蛋白酶   苯酰氨类抑制剂   分子动力学  

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