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连续近交下家猪微卫星基因组杂合度与经济性状的相关性研究
从已定位于家猪01、02、11、13、17、18号染色体上的遗传标记中选用56个具有足够覆盖率的微卫星标记,对1个连续5代近交家系共192头家猪进行了基因组扫描分析。用平均微卫星标记杂合度估计基因组杂合度(GH)。GH对于屠宰重(SWT)和日均屠宰重(ADSG)为显著正相关效应,对于背膘厚(BFDP)的相关效应不显著且方向也不一致。GH的相关效应随近交世代递增而呈非线性变化趋势:GH对于SWT和ADSG的相关效应在近交前2世代呈上升趋势,2世代分别到达最大值(22.43kg和0.132kg / d),此后随近交世代的递增而递减;GH对于BFDP的相关效应随世代递增而非线性递减。微卫星杂合度的相关效应在不同染色体间存在较大差异,对SWT和ASDG均表现为正效应,其中又以13号染色体标记杂合度的相关效应为最大(6.306kg和0.032kg / d),其次依次为1号、17号、18号、2号和11号。各染色体微卫星标记杂合度对于BFDP的相关效应估值的标准误差大,且效应方向不一致(18号染色体为正效应,其余染色体为负效应)。由此得到如下3点启示:第一,对于经济性状重要的基因(e.g.QTL)不是均衡分布于各条染色体上,此差异可能反应出生物性状决定在染色体以及分子分工上的差异;第二,由于基因、基因互作和基因组背景效应的复杂性,基因(组)杂合度与性能间不为简单的相关关系。该关系还可能由于标记数目不够或是标记选择不适当而误导;第三,由于高度近交(如连续同胞交配)下较高的连锁不平衡所致,有害基因可能以较高的概率与中性标记连锁遗传,由此可能部分或全部抵消杂合优势的表现,甚至出现杂合劣势。
作 者: 吴晓林 李栒 Merete Fredholm 作者单位: 吴晓林(湖南省畜牧兽医研究所动物分子生物学实验室,)李栒(湖南农业大学)
Merete Fredholm(丹麦皇家兽医农业大学动物科学与医学系,)
刊 名: 遗传学报 ISTIC SCI PKU 英文刊名: ACTA GENETICA SINICA 年,卷(期): 2001 28(1) 分类号: Q953 关键词: 微卫星 近交 杂合度 基因组扫描 家猪【连续近交下家猪微卫星基因组杂合度与经济性状的相关性研究】相关文章:
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