黄瓜CsEXP 10基因的电子克隆及生物信息学分析

黄瓜CsEXP 10基因的电子克隆及生物信息学分析

以黄瓜CsEXP10 cDNA片段为信息探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得了1191bp的cDNA序列.应用生物信息学软件预洲了该蛋日的理化性质、卷曲螺旋、疏水性、信号肽、跨膜结构、糖基住点、活性位点、亚细胞定位及二级和高级结构.结果表明:该蛋白是一个疏水性稳定蛋白,定位于细胞壁,含有4个α-螺旋,11个β-折叠,5个跨膜区域,10个糖基化位点,具有催化域和多糖结合域两个结构域.

作 者： 孙涌栋 张传来 罗未蓉 张兴国 SUN Yong-dong ZHANG Chuan-lai LUO Wei-rang ZHANG Xing-guo   作者单位： 孙涌栋,张传来,罗未蓉,SUN Yong-dong,ZHANG Chuan-lai,LUO Wei-rang(河南科技学院园林学院,新乡,453003)

张兴国,ZHANG Xing-guo(西南大学园艺园林学院,重庆,400715) 

刊 名： 生物信息学  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分类号： Q343.1  关键词： 黄瓜   CsEXP10基因   电子克隆   生物信息学  

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