共存于厌氧真菌分离培养液中瘤胃甲烷菌的检测及其多样性分析

共存于厌氧真菌分离培养液中瘤胃甲烷菌的检测及其多样性分析

对分离自山羊瘤胃的真菌分离培养液中甲烷菌进行16S rDNA扩增、DGGE分析、RFLP及测序分析,研究共存于真菌分离培养液中甲烷菌的种类及其多样性.DGGE结果显示:从厌氧真菌分离至第45代,甲烷菌多样性指数由1.32降至0.99,相似性最低为34.7%;第45代至62代,多样性指数由0.99升至1.15,相似性最低为89.2%.RFLP多态性分析69个克隆共得到5个操作分类单元,选择其中6个具有代表性的序列进行测序.序列及系统进化分析表明,属于其中3个操作分类单元的克隆最相似菌都是Uncultured archaeal symbiont PA202,相似性均为95%,没有与这些克隆相似性较高的已培养甲烷菌;属于另外2个操作分类单元的克隆最相似菌都是Uncultured rumen methanogen 956,相似性均为97%,最相似已知菌为Methanobrevibacter sp. NT7,相似性为97%.结果表明,真菌培养液中存在目前尚未分离培养的瘤胃甲烷菌.

作 者： 成艳芬 毛胜勇 裴彩霞 刘建新 朱伟云 CHENG Yan-fen MAO Sheng-yong PEI Cai-xia LIU Jian-xin ZHU Wei-yun   作者单位： 成艳芬,毛胜勇,裴彩霞,朱伟云,CHENG Yan-fen,MAO Sheng-yong,PEI Cai-xia,ZHU Wei-yun(南京农业大学消化道微生物研究室,南京,210095)

刘建新,LIU Jian-xin(浙江大学动物科学学院,杭州,310029) 

刊 名： 微生物学报  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA MICROBIOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2006 46(6)  分类号： Q93  关键词： 厌氧真菌   甲烷菌   DGGE   RFLP  

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