- 相关推荐
全基因组预测目标基因的新方法及其应用
运用隐马尔可夫模型, 利用Perl编程, 以几种模式生物的蛋白质数据库为基础, 构建了目标基因的全基因组预测的新方法.该方法具有高通量, 准确度高且操作简易等优点, 特别在多结构域蛋白家族预测上更显优势.应用该方法对几种模式生物的全基因组PPR和TPR蛋白家族进行了预测, 其中粳稻日本晴中含有536个PPR蛋白、199个TPR蛋白;籼稻9311中含有519个PPR蛋白、177个TPR蛋白;拟南芥中含有735个PPR蛋白、292个TPR蛋白;红藻中6个PPR蛋白、32个TPR蛋白;蓝细菌以及古细菌中没有PPR蛋白, 但蓝细菌含有10个TPR蛋白, 古细菌有4个TPR蛋白, 并对所得结果进行了进一步生物信息学分析.
作 者: 张菁晶 冯晶 朱英国 李阳生 ZHANG Jing-Jing FENG Jing ZHU Ying-Guo LI Yang-Sheng 作者单位: 张菁晶,朱英国,李阳生,ZHANG Jing-Jing,ZHU Ying-Guo,LI Yang-Sheng(武汉大学生命科学院植物发育生物学教育部重点实验室,武汉,430072)冯晶,FENG Jing(武汉大学高科技研究与发展中心,武汉,430072)
刊 名: 遗传 ISTIC PKU 英文刊名: HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 2006 28(10) 分类号: Q3 关键词: 基因预测 Perl HMM 全基因组 PPR TPR【全基因组预测目标基因的新方法及其应用】相关文章:
质谱技术及其在后基因组时代中的应用04-27
基因工程及其应用 教案04-25
即刻早基因ZENK的基因功能及其应用进展04-26
河流随机水质预测模型及其应用04-26
人类基因研究及其技术应用的深层思考04-27
人类基因研究及其技术应用的伦理思考04-27
正交小波网络及其在经济预测中的应用04-26