拟南芥钙调素结合蛋白cDNA克隆的分离和初步鉴定

时间:2023-04-26 19:30:05 生物医学论文 我要投稿
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拟南芥钙调素结合蛋白cDNA克隆的分离和初步鉴定

以生物素标记的钙调素为探针,从拟南芥(Arabidopsis thaliana)λZAPⅡ cDNA表达文库中分离到9个阳性克隆.融合蛋白经CaM-gel overlay分析,其中Y1编码的融合蛋白在1 mmol/L Ca2+存在下与胶体金标记的钙调素有明显结合.序列测定结果显示其外源片段全长为726 bp,含有一个476 bp的开放阅读框.GenBank数据库搜索及同源性分析结果表明该序列为拟南芥1号染色体基因组5 661~7 013序列,编码一未知蛋白,但与真核生物翻译起始因子5A(eIF-5A)具87%的同源性,并具相似的分子量、等电点和相同的保守序列.与eIF-5A的结构特征比较,可初步确定Y1编码的蛋白为真核生物翻译起始因子5A家族中的新成员.即拟南芥1号染色体5 661~7 013序列为一尚未报道的翻译起始因子基因.蛋白质二级结构预测其C-端122~135氨基酸残基处有一双亲α-螺旋结构,这一结构与大多数钙调素结合蛋白中的钙调素结合位点的结构特征一致.该序列已提交NCBI BankIt数据库,登录号为AF492850.

作 者: 詹红利 李翠风 祁倩 李国亮 凌启阆 Zhan Hongli Li Cuifeng Qi Qian Li Guoliang Ling Qilang   作者单位: 南开大学,生物化学与分子生物学系,天津,300071  刊 名: 南开大学学报(自然科学版)  ISTIC PKU 英文刊名: ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NANKAIENSIS  年,卷(期): 2006 39(3)  分类号: Q75  关键词: 钙调素结构蛋白   真核生物翻译起始因子5A(eIF-5A)   表达文库筛选  

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