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滑桃树不同器官伴生细菌多样性的分子特征
应用不依赖于培养的16S rRNA基因技术,揭示滑桃树根皮、茎皮以及种子伴生细菌的种类多样性,为建立伴生细菌的宏基因组文库奠定基础.基于我们新近发表的植物伴生菌富集方法,建立富集和未富集样品的全长16S rRNA基因文库,随机挑取至少100个克隆进行酶切分型并测序,根据16S rDNA的部分序列推测其所属伴生菌的种类.结果表明,所检测的细菌克隆大部分属于γ-Proteobacteria,有少量来源于α-Proteobacteria或放线菌(Actinobacteria),也包括不可培养或分类地位不明确的细菌.经过富集,16S rRNA基因文库中细菌克隆的比例和序列多样性显著增加,根皮的伴生细菌种类最为丰富,其次是成熟种子和茎皮;幼嫩种子16S rDNA文库的细菌克隆比例较小(1.18%),说明幼嫩种子的伴生菌最少.
作 者: 王浩鑫 焦军影 曾英 沈月毛 WANG Hao-Xin JIAO Jun-Ying ZENG Ying SHEN Yue-Mao 作者单位: 王浩鑫,焦军影,WANG Hao-Xin,JIAO Jun-Ying(中国科学院昆明植物研究所,云南,昆明,650204;中国科学院研究生院,北京,100039)曾英,沈月毛,ZENG Ying,SHEN Yue-Mao(中国科学院昆明植物研究所,云南,昆明,650204)
刊 名: 云南植物研究 ISTIC PKU 英文刊名: ACTA BOTANICA YUNNANICA 年,卷(期): 2006 28(3) 分类号: Q94 关键词: 微生物富集 植物伴生菌 16S rDNA 微生物多样性 滑桃树 不可培养微生物【滑桃树不同器官伴生细菌多样性的分子特征】相关文章:
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